男性尿结石具体哪里痛还需要根据患者的具体病情来分析。如果患者是肾结石和输卵管结石，疼痛主要集中在腰部;如果是膀胱结石，疼痛的部位主要是下腹部;如果是尿道结石主要是尿道疼痛。

尿结石除了疼痛外，一般患者还会伴有排尿困难、点滴状排尿等症状，如果患者出现腰部胀痛、尿痛等症状，建议患者及时到医院就诊检查，通过彩超、ct或x线等检查来明确诊断。